Baldintza fisiologikoak imitatzeak metalezko aglutinatzaileak aurkitzen laguntzen die ikerlariei
Metal ioiak lotzen dituzten molekula txikiak identifikatzeko metodo bat garatu dute ikertzaileek.Metal ioiak ezinbestekoak dira biologian.Baina ioi metaliko horiek zein molekularekin elkarreragiten identifikatzea zaila izan daiteke.
Analisirako metabolitoak bereizteko, metabolomika konbentzionaleko metodoek disolbatzaile organikoak eta pH baxuak erabiltzen dituzte, eta horrek metal-konplexuak disoziatzea eragin dezake.San Diegoko Kaliforniako Unibertsitateko Pieter C. Dorresteinek eta lankideek konplexuak elkarrekin mantendu nahi zituzten analisirako, zeluletan aurkitzen diren jatorrizko baldintzak imitatuz.Baina molekulak bereizteko garaian baldintza fisiologikoak erabiliko balituzte, probatu nahi zuten baldintza fisiologiko bakoitzeko bereizketa baldintzak berriro optimizatu beharko lituzkete.
Horren ordez, ikertzaileek ohiko bereizketa kromatografiko baten eta masa-analisi espektrometriko baten arteko baldintza fisiologikoak sartzen dituen bi etapako ikuspegia garatu zuten (Nat. Chem. 2021, DOI: 10.1038/s41557-021-00803-1).Lehenik eta behin, extract biologiko bat bereizi zuten ohiko errendimendu handiko kromatografia likidoa erabiliz.Ondoren, zutabe kromatografikotik irteten den fluxuaren pH-a egokitu zuten baldintza fisiologikoak imitatzeko, ioi metalikoak gehitu eta nahasketa masa-espektrometriarekin aztertu zuten.Bi aldiz egin dute analisia metalekin eta metalik gabeko molekula txikien masa-espektroak lortzeko.Metalak zein molekulek lotzen dituzten identifikatzeko, forma gailurrak erabiltzen dituen metodo konputazionala erabili dute, lotu eta lotu gabeko bertsioen espektroen arteko konexioak ondorioztatzeko.
Baldintza fisiologikoak gehiago imitatzeko modu bat, Dorresteinek dioenez, sodioa edo potasioa bezalako ioi kontzentrazio handiak eta interesgarri den metalaren kontzentrazio baxuak gehitzea litzateke.«Lehiaketa esperimentu bihurtzen da.Funtsean esango dizu, ados, baldintza horietan molekula honek sodioa eta potasioa edo zuk gehitu duzun metal bakarra lotzeko joera handiagoa duela ", dio Dorresteinek."Aldi berean metal ezberdin asko infusi ditzakegu, eta testuinguru horretan hobespena eta selektibitatea benetan uler ditzakegu".
Escherichia coli-ren kultura-estraktuetan, ikertzaileek burdina lotzen duten konposatu ezagunak identifikatu zituzten, hala nola yersiniabactina eta aerobactina.Yersiniabactinaren kasuan, zinka ere lotu dezakeela aurkitu dute.
Ikertzaileek metalak lotzen dituzten konposatuak identifikatu zituzten ozeanoko materia organiko disolbatua bezain konplexuak laginetan."Inoiz begiratu dudan lagin konplexuenetako bat da hori", dio Dorresteinek."Ziurrenik, petrolio gordina bezain konplexua da, ez bada konplexuagoa".Metodoak azido domoikoa kobrea lotzen duen molekula gisa identifikatu zuen eta Cu2+ dimero gisa lotzen duela iradoki zuen.
"Lagin batean metalak lotzen dituzten metabolito guztiak identifikatzeko ikuspegi omik bat oso erabilgarria da metalen kelazio biologikoaren garrantziagatik", Ipar Carolinako Estatuko Unibertsitateko landareek eta mikrobioek ekoitzitako metalak lotzen dituzten metabolitoak aztertzen dituen Oliver Baarsek idatzi du. posta elektronikoa.
"Dorresteinek eta lankideek saiakera dotore eta beharrezkoa eskaintzen dute zelularen ioi metalikoek zer eginkizun fisiologikoa izan dezaketen hobeto aztertzeko", idatzi du posta elektroniko batean Albert JR Heckek, Utrechteko Unibertsitateko masa espektrometria jatorrizko analisietan aitzindariak."Hurrengo urrats posible bat litzateke zelulatik jatorrizko baldintzetan metabolitoak ateratzea eta horiek ere jatorrizko baldintzetan zatikatzea, ikusteko zein metabolitok zelula metalezko ioi endogenoak daramatzaten ikusteko".
Kimika eta Ingeniaritza Berriak
ISSN 0009-2347
Copyright © 2021 American Chemical Society
Argitalpenaren ordua: 2021-12-23